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DICOM zu NIfTI Konverter

Wandeln Sie eine CT-, MRT- oder PET-Studie in .nii.gz-Volumen mit korrekter Affine um, bereit für FSL, SPM, 3D Slicer oder Ihre eigene Pipeline. Die Umwandlung läuft auf Ihrem Computer. Ihre Aufnahme wird nie hochgeladen.

Ziehen Sie Ihre DICOM-Dateien, den Studienordner oder eine .zip hierher

Nichts wird hochgeladen. Dateien werden auf diesem Computer gelesen und umgewandelt.

100 % lokal: Ihre Dateien werden im Browser gelesen und umgewandelt und nie hochgeladen.

So funktioniert es

Drei Schritte, alle auf Ihrem eigenen Rechner.

1. Studie ablegen

Einzelne .dcm-Dateien, ein ganzer Ordner oder ein .zip-Archiv. Zuerst werden nur die Header gelesen, es wird noch nichts Großes geladen.

2. Serien prüfen

Jede Serie wird mit Abmessungen, Voxelabstand und Datentyp aufgeführt. Wählen Sie aus, was Sie brauchen.

3. Volumen speichern

Eine .nii.gz pro Serie, geschrieben während sie entsteht. Mehrere Serien kommen als .zip mit einem Ordner voller Volumen zurück.

Format

Warum nach NIfTI umwandeln

DICOM speichert eine Studie als Hunderte einzelner Dateien, jede eine Schicht mit umfangreichem Header. NIfTI legt dieselbe Aufnahme als ein einziges 3D-Array plus kompakten Header ab, der beschreibt, wo es im Raum liegt. Nahezu jedes Neuroimaging- und Forschungswerkzeug erwartet Letzteres.

Forschungs-Pipelines

FSL, SPM, AFNI, FreeSurfer, ANTs und nipype lesen NIfTI nativ. Registrierungs-, Segmentierungs- und Statistikwerkzeuge sind auf dieses Format hin geschrieben.

3D-Visualisierung

3D Slicer, ITK-SNAP und MRIcroGL öffnen eine .nii.gz als ein Volumen, sodass Sie neu schneiden, rendern und segmentieren können, ohne einen Ordner zu importieren.

Maschinelles Lernen

nnU-Net, MONAI und TorchIO erwarten NIfTI. Ein einzelnes komprimiertes Array pro Aufnahme lässt sich weit leichter versionieren, weitergeben und laden als ein Verzeichnis voller Schichten.

Datenschutz by Design

Ihre Aufnahme verlässt Ihr Gerät nicht

Parsen, Dekodieren und Schreiben geschehen alle lokal in Ihrem Browser. Ihre Dateien werden nie zu DocOrbit oder Dritten hochgeladen und nichts wird auf einem Server gespeichert. Wenn Sie später eine Zweitmeinung anfordern, sind Ihre Aufnahmen bei der Übertragung und im Speicher verschlüsselt und werdenniemals zum Training von KI-Modellen verwendet.

Kein Upload

Dateien werden direkt von Ihrem Browser geöffnet. Sie berühren unsere Server nie.

Kein Konto nötig

Keine Registrierung, kein Login, keine E-Mail und kein Limit, wie viele Studien Sie umwandeln.

Funktioniert offline

Sobald die Seite geladen ist, können Sie die Verbindung vollständig trennen und trotzdem umwandeln.

DICOM zu NIfTI FAQ

Wird meine Aufnahme irgendwohin hochgeladen?

Nein. Die gesamte Umwandlung findet auf Ihrem eigenen Computer statt: Ihr Browser liest die Dateien, dekodiert die Bilddaten und schreibt die NIfTI-Datei. Nichts wird an DocOrbit oder Dritte gesendet, nichts wird auf einem Server gespeichert. Sie können nach dem Laden der Seite die Internetverbindung trennen, und es funktioniert weiterhin.

Kann das Werkzeug eine ganze Studie oder eine sehr große Serie verarbeiten?

Ja, genau dafür ist es gebaut. Der Konverter liest zuerst nur den Header jeder Datei, um die Schichtreihenfolge zu bestimmen, und schreibt das Volumen dann Schicht für Schicht in eine komprimierte Datei. Das Volumen wird nie vollständig im Arbeitsspeicher zusammengesetzt, sodass eine mehrere Gigabyte große Serie ungefähr mit dem Speicher einer einzelnen Schicht auskommt. In Chrome und Edge wird die Ausgabe direkt in die gewählte Datei geschrieben, während sie entsteht.

Welche DICOM-Dateien werden unterstützt?

CT, MRT, PET und alle anderen Bildserien. Unkomprimiertes DICOM, RLE, JPEG Baseline und Lossless, JPEG-LS, JPEG 2000 und HTJ2K werden dekodiert. Legen Sie einzelne .dcm-Dateien, einen ganzen Studienordner oder ein .zip-Archiv ab; Serien werden anhand der SeriesInstanceUID automatisch getrennt.

Stimmt die Orientierung?

Ja. Die Affine wird aus ImageOrientationPatient, ImagePositionPatient und PixelSpacing gebildet, von der LPS-Konvention von DICOM nach RAS für NIfTI umgerechnet und in sform und qform geschrieben. Der Schichtabstand stammt aus dem gemessenen Abstand aufeinanderfolgender Schichtpositionen und nicht aus SliceThickness, das bei Lücken oder Überlappung falsch ist. Volumen werden in FSL, SPM und 3D Slicer korrekt orientiert geladen.

Was passiert mit Hounsfield-Einheiten und den Rescale-Werten?

Die gespeicherten Pixelwerte werden unverändert geschrieben, RescaleSlope und RescaleIntercept wandern in die Felder scl_slope und scl_inter des NIfTI-Headers, so wie es dcm2niix macht. Ihr Analysewerkzeug wendet sie an und Sie erhalten exakte Hounsfield-Einheiten. Weichen die Schichten einer Serie in den Rescale-Werten voneinander ab, wird das Volumen stattdessen als float32 mit bereits angewendeten Werten geschrieben.

Was ist mit Diffusions- oder Multi-Echo-Serien?

Eine 4D-Serie enthält mehrere Volumen an denselben Schichtpositionen. Der Konverter erkennt die wiederholten Positionen, schreibt das erste Volumen und weist Sie darauf hin. Er erzeugt keine bvec/bval-Dateien; für Diffusions-Pipelines bleibt dcm2niix das richtige Werkzeug.

Kann ich eine .zip-Datei einer Studie umwandeln?

Ja. Legen Sie die .zip einfach ab, sie wird an Ort und Stelle gelesen: das Verzeichnis des Archivs wird ausgewertet und jede Datei darin erst dann entpackt, wenn sie gebraucht wird, eine nach der anderen. Das Archiv wird nie vollständig entpackt, eine gezippte Studie braucht also nicht mehr Speicher als ein Ordner mit losen Dateien. Passwortgeschützte Archive werden nicht unterstützt.

Kann eine Radiologin oder ein Radiologe die Aufnahme befunden?

Ja. DocOrbit bietet unabhängige, KI-gestützte Zweitmeinungen zu radiologischen und nuklearmedizinischen Aufnahmen, geprüft von einer fachärztlich zertifizierten, subspezialisierten Radiologin oder einem Radiologen, in der Regel innerhalb von 24 bis 48 Stunden.

Weitere kostenlose Werkzeuge

Alle laufen in Ihrem Browser. Nichts wird hochgeladen.

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